Forklar det generelle princip i gel-elektroforesen og hvorfor forskellige DNA-stykker placerer sig som de gør?

De forskellige DNA-stykker placerer sig som de gør i gel-elektroforesen fordi man i gel-elektroforesen udnytter den negative ladning som DNA har til at adskille DNA af forskellige længder i en prøve. Den negative ladning stammer fra phosphatgrupperne i hvert nukleotid af DNA'et. DNA’et trække gennem gelen mod den positive side. De mikroskopiske huller i gelen gør bevægelsen sværere for DNA’et, jo længere det er. Derfor løber de korte DNA-molekyler hurtigere igennem end de længere DNA-molekyler.

Er det svar på spørgsmålet? 

Det er på grund af den negative ladning DNA har, at det kan bevæge sig fra den ene ende af gelen til den anden, idet DNA'et tiltrækkes af den positive ladning, der tilføres den modsatte ende af dine brønde, men som Akademsik også skriver, så er det fordi der er en masse små huller i gelen, og jo længere/tungere DNA'et er, des sværere er det at trænge igennem de små huller.

Derfor vil du se, at de DNA-fragmenter, der har bevæget sig længst fra brøndene er dem, der er kortest/lettest, mens dem, der har bevæget sig den korteste distance er de længere/tungere DNA-fragmenter.