Bioteknologi

Databasenavne: NM, NP, ENST, ENSP...

25. maj 2016 af TineS94 (Slettet) - Niveau: Universitet/Videregående

Hej, jeg sidder med en større opgave og har i en artikel fundet en flot tabel, hvor de har listet udvalgte patogene allel varianter op i en tabel med headlines: DNA Nucleotide Change, Protein Amino Acid Change og Reference sequence.

Reference sekvensen de har valt er en NM og NP som gælder for alle deres alleler.
Jeg vil gerne lave min egen tabel for allelvarianter af CPT1A, som jeg har fundet på OMIM.
Problemet er bare, at når jeg klikker på en af mutationerne der er listet i OMIM, bliver jeg henvist til ENSEMBL. I ENSEMBL er der opgivet en del "ensembl gen sekvenser". Jeg vil umildbart have det bedre med at skrive NM og NP i stedet for ENST og ENSP, da det er det jeg oftest har set og arbejdet med.
Er der nogen måde hvorpå jeg kan finde NM og NP reference sekvenser for Ensample sekvenserne?

http://omim.org/entry/600528?search=CPT1A&highlight=cpt1a

http://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Variation/Explore?r=11:68780237-68781237;toggle_HGVS_names=open;v=rs80356778;vdb=variation;vf=18587866

Og jeg er nok også lidt forvirret over betegnelserne NM, NP, ENST og ENSP.

På forhånd mange tak :) 

Vedhæftet fil: ENSEMBL.PNG

Skriv et svar til: Databasenavne: NM, NP, ENST, ENSP...

Du skal være logget ind, for at skrive et svar til dette spørgsmål. Klik her for at logge ind.
Har du ikke en bruger på Studieportalen.dk? Klik her for at oprette en bruger.