MALDI - TOF

MALDI TOF står for: Matrix assisted laser desorption ionization og TOF står for Time of flight. Det er et massespektrometer hvor man kan måle massen af proteiner (med meget stor nøjagtighed).

op ad y-aksen kan der stå mange tid (f.eks abundance, Absorbtion etc.) men på x-aksen står der næsten altid m/z som står for masse over ladning, som er den måde man måler massen på (ved hjælp af nogle formler kan man så få masse i Da)

Tak :D

Det skulle gerne være efter at proteinet er sepereret men hvorfor er der så flere toppe?

Det er lidt sværere at svare på. Når man skal lave massespek på et stof skal det ioniseres. Den kan ske på flere måder. Den højeste i et MALDI TOF spektrer er normalt: [M+H]⁺ (når det er positiv ionisering). Her har vi massen + massen af H over 1 (m/z). der kan dog også ske det at vi får 2 H [M+2H]²⁺ (altså massen + massen af 2H over 2) og så kan der også ske det at 2 proteiner "klasker" sammen så du får: [M₂+H]⁺ hvilket giver 2*massen + massen af H over 1. Der vil også være absorbtion af matrixen samt en masse random noise.

Er ikke sikker på jeg helt forstår det men tusind tak :)

Prøv at læse det der står på den engelske wiki. Har ikke selv læst det men det plejer at være meget godt:

http://en.wikipedia.org/wiki/Matrix-assisted_laser_desorption/ionization