Fosforylering af glukose

1) er et ret dårligt spørgsmål da der kan være mange svar men grunden til at cellen bruger en ATP er for at sørge for at glucose ikke kan forlade cellen igen.

2)  Her skal du se på hvilken reaktionstype der sker i reaktionen. Prøv at skriv op hvad der rent faktisk sker og så kan vi se på det.

3) Her må du selv til at lede i din bog men prøv at kig i kapitlet om DNA ;)

Super. Tusind tak - det hjælp lidt mere med forståelsen! ;)

I opgave 2 er jeg kommet frem til at det i 1. reaktion er enzymet hexokinase, som katalyserer reaktionen.

I opgave 3 har jeg fundet ribose, og deoxyribose (jeg mangler stadig én), og de har betydning for cellernes dannelse af DNA og RNA.

Prøv at kigge på nogle af aminosyrerne i 3

I 2 synes jeg du skal skrive op hvad der sker i hver reaktion og så tager vi den der fra. Jeg ville skrive det op som: (i 1 som du rigtigt nok siger er en kinase)

En phosphat grupper overføres fra ATP til Glucose.

Det øverste du skrev med at cellen bruger ATP, for at sørge for at glukosen ikke kan forlade cellen igen, vil jeg gerne have lidt mere uddybet, hvis det er muligt. :)

Ja det kan jeg godt men den vigtigste årsag kræver en vis forståelse men den tager vi til sidst:

1. Transport over membranen foregår gennem diverse transportere som har højest affinitet for glucose og ikke G6P (glucose-6-phosphat).

2. Ladede molekyler kan ikke diffundere over membran.

3. (og den svære) Når du fosforylere ændrer du gradienten for glucose. Det kan være nødvendigt (både for transport at glucose den ene og den anden vej over membranen) for at sørge for at den fri energi ikke bliver for høj.

Lad os forsimple meget og sige vi har ECM (extracellulær matrix) og ICM (intracellulær matrix) på hver side af cellemembranen:

ECM                     ICM

                 *      |    **        *

               **      |    **

            *    **   |   *

              **       |   *

Her er en lidt større koncentration uden for cellen ind inden i cellen. Dette gør at at gradienten vender ind mod ICM. Gradienten er dog meget lav da der kun er et glucose molekyle mere i ECM end i ICM. Hvis vi fjerner nogle fra ICM (laver dem om til G6P) bliver gradienten større og derved bliver den fri energi mindre (ud fra formlen):
G=-RT*ln((Glucose_inde)/(Glucose_Ud)).

Altså forbedres cellens evne til at transportere glucose over membranen og derved sænkes glucosens evne til at gå den anden vej.

Okay, tak :)

I opgave 2 har jeg skrevet således:

I 1. reaktion (som jeg beskrev i opgave a) bliver glukose omdannet til glukose-6-fosfat ved forbrug af ATP, hvorefter glukose-6-fosfat igen bliver omdannet til 6-fosfoglukonat. Denne reaktion katalyseres af en kinase - nærmere enzymet hexokinase, der ved fosforylering omdanner sukker til fosfat (som vi også ser ske i 1. reaktion).
I 2. reaktion bliver 6-fosfoglukonat omdannet til ribulose-5-fosfat. Herved sker der en frigivelse af CO2. Derudover sker der også en dannelse af alkohol. ---> Problemet er at jeg ikke helt ved hvad dette enzym hedder, og gør :(

Du skal beskrive hvad du ser og kun hvad du ser. Altså i 2:

Der sker en decarboxylering (frigivelse af CO2) og en oxidation.

Denne her kan være lidt svær fordi der faktisk sker 2 processer. Hvis der kun skete en decarboxylering ville den hedde decarboxylase og hvis der kun skete en oxidation ville den hedde oxidase eller dehydrogenase. (brugt interchangeable).

Her er det dog en dehydrogenase (el. oxidase) der vil være det rigtige svar.

Hvad sker der i reaktion 3?

Ja, den er lidt besværlig :)

Jeg er ikke nået til reaktion 3 endnu ;)

Dvs;

I 2. reaktion bliver 6-fosfoglukonat omdannet til ribulose-5-fosfat. Herved sker der en decarboxyering (dvs. frigivelse af CO2), en oxidation og en dannelse af alkohol. Dvs. der er sket en dehydrogenase. --> Hvad er enzymet?

Hvor sker der en oxidation?

Nej dehydrogenase er enzymet.

du ser en omdannelse af en alkohol til en keton og det er en oxidation. Og der sker da ikke en dannelse af en alkohol...

Det sidste forstår jeg ikke. Der står da formelen for alkohol i reaktion 2? Så må der jo have sket en reaktion så alkhol er blevet dannet. Jeg kan også forstå at alkoholen i 3. reakiton bliver omdannet til aldehyd? Eller det er måske mig, som tager helt fejl? :)

Prøv at tæl dine grupper. I reaktionsprodukt 1 har du 4 alkoholer (hvor syre OH samt den modificerede O-H gruppe (O-P) ikke er talt med).

I den næste har du kun 3 (den ene omdannet til en keton) ergo kan der ikke være dannet nogen OH grupper.

(De har også samme position som før)

Hmm, så forstår jeg ikke hvad der sker i 3. reaktion?

Er arabinose en pentose? :)

I reaktion 3 ser vi en flytning af en gruppe.

Alkoholen flyttes fra position 1 til pos 2 (carbonylen fra pos 2 til pos 1).

Når der sker en intern omrokkering i molekylet kaldes reaktionstypen  ___?

En isomerase? :)

Er arabinose en pentose?

Hvor mange carbon har den? (ja isomerase og der sker en isomerisering)

Nårh ja, det kan jeg jo godt svare på. Den har 5, så selvfølgelig er den det. :) Men så bruger jeg den til den sidste opgave.
 

Jeg ville jeg nok vælge noget cellulært lidt vigtigere. Du kunne fx tage et kig på nogle af de reduktionsmidler som cellen har (NADH/NADPH/FADH2). Men det er helt fint at bruge arabinose... Den er bare lidt kedelig efter min mening ;)

Ribose bruges i mange tilfælde, og har derved givet 3 eksempler - RNA, ATP og NAD+. Derved synes jeg det kunne være meget godt med arabinose, da den ikke kan benyttes af mennesker. :) Så får man også lidt økologi.

Men jeg vil bare lige sige tusind tak for hjælpen, du har været en stor hjælp. Det var virkelig rart! :D