Biologi

Oversættelse af basesekvens

21. april 2008 af trice (Slettet)

Jeg skal angive en mulig basesekvens for en PCR-primer, der anvendes ved opformering af DNA.

DNA sekvens: TGTAGCCT CAGCAGCAG… CAGCAGCAG CACCTAGCT

PCR-primer: ACAUCGGA GUCGUCGUC… GUCGUCGUC GUGGAUCGA

Jeg er i tvivl om hvorvidt det er korrekt??

Brugbart svar (0)

Svar #1
21. april 2008 af Dr. MolBio (Slettet)

Det er umiligt at sige uden din 3´, 5´ orientering... hvad er op og ned?

Svar #2
21. april 2008 af trice (Slettet)

arh, sorry:
DNA sekvens: 5'...TGTAGCCT CAGCAGCAG… CAGCAGCAG CACCTAGCT...3'

Brugbart svar (0)

Svar #3
21. april 2008 af Dr. MolBio (Slettet)

OK, der skal bruges følgende primere:

3´GTCGTCTCGTGGATCGANNNNNNNNNNNNNN 5´

og

3´ CTGCTGCTGAGGCTACANNNNNNNNNNNNN 5`

Hvor N kan være hvilkensomhelst base (evt. for at indføre et restriktionssite)

Vær opmærksom på om primerne kan danne en signifikant sekundær struktur, samt om de kan danne hydrogen bindinger på tværs (denna kan til dels undgåes ved at vælge den rette Tm)

Held og lykke...

Svar #4
21. april 2008 af trice (Slettet)

Tusind tak for hjælpen :-)! Dog lige et lille spørgsmål til for at være på den helt sikre side:

Der skal bruges to primere, fordi DNA jo er dobbeltstrenget og derfor skal have en til hver streng, der splittes op under PCR?

Brugbart svar (0)

Svar #5
21. april 2008 af Dr. MolBio (Slettet)

Yes; en coding og en antisense streng...

Skriv et svar til: Oversættelse af basesekvens

Du skal være logget ind, for at skrive et svar til dette spørgsmål. Klik her for at logge ind.
Har du ikke en bruger på Studieportalen.dk? Klik her for at oprette en bruger.