Alfa helix

Enzymet hedder helicase. DNA-dobbeltstrengen opdeles, og der opstår to seperate strenge. I den ende af dobbbeltstrengen som der opdeles, fås en 5' ende og en 3' ende. En primer vil binde sig på enkeltstrengen (en primer er et lille stykke DNA på måske 5-10-20 nukleotiders længde, som er komplementær til den enkelte streng. Det vil sætte sig på DNA strengen, og danne grundlag for dannelsen af den nye streng).

5' - ATTAAAGC ..........................- 3'     enkeltstrengen ("parental" strand, leading strand)

3' - TAATTTCG - 5' ---->                      De første 8 baser her skal forestille at være primeren   (pilen viser, hvilken vej DNA polymerasen bevæger sig, hvorved den forlænger den nye DNA-streng)

DNA polymerasen virker ved at bygge videre på primeren i dens 5' retning (Dette svarer til, at DNA polymerasen bevæger sig fra 5' mod 3' på enkeltstrengen.

Ovenstående gælder for LEADING strand!

Lagging strand er jo orienteret 3' - 5' (modsat  leading strand ovenfor), og det giver et problem fordi DNA polymerasen kun kan bevæge sig i retning fra 5' enden mod 3' enden. Derfor sætter primeren sig, og så vil DNA polymerasen forlænge primeren i retningen VÆK fra helicasen, og så til gengæld ikke i mindre bidder. Derfor bliver lagging strand altså ikke lavet som én lang streng i første omgang, men som flere mindre bidder.

Jeg ved det det er sindssygt forvirrrende forklaret, og du er en stjerne hvis du virkelig kan forstå min ufatteligt ringe forklaring :)

Forestil dig at du står med jakken lynet i, og skal smøre den (jeg har lært, at man smører en lynlås med stearin)

Den ende af lynlåsen i højre side som er mod din hage, kalder du 5', og den anden ende 3'.

I venstre side, ved din hage, har du 3' enden, og modsat 5' enden. Helicasen svarer til, at du langsomt lyner jakken ned. I højre side kan DNA polymerasen følge umiddelbart efter som helicasen lyner lynlåsen op, der vil sætte sig en primer helt oppe ved din hage, og DNA polymerasen vil kunne løbe hele vejen ned til lynlåsens slutning, og derved danne en ny DNA streng.

I venstre kan DNA polymerasen derimod kun bevæge sig i retningen opad, fordi den kun kan gå i retning mod 3' enden på parental strand. Derfor må du lyne jakken 10 cm ned, og sætte en primer. På dette sted vil der sætte sig en primer, og DNA polymerasen vil så bevæge sig opad i retning af din hage, til den når til lynlåsens slutning. Imens lyner helicasen yderligere 10 cm ned i lynlåsen. Her vil en ny primer sætte sig, og DNA polymerasen vil så forlænge primeren de 10 cm op, til den støder på den første ny-syntetiserede streng.

Undskyld det rodede sprog :)

Hej Mads

Tusind tak for dit hurtige svar :0)

Og stort Tak for hjælpen :0)

Stort knuzzzz

Alberte06

Velbekomme!

Iøvrigt skal bemærkes, at lagging strand, som så siddder på sin parental string, sådan som det er forklaret ovenfor, i teorien vil bestå af flere små bidder.. Det er ikke fordi der mangler nogle nukleotider eller noget, men det skal bemærkes at DNA polymerasen IKKE er i stand til at lave bindingen mellem sukker- og fosfatenhederne i DNA'ets backbone. DNA'et er altså ikke helt "smooth" endnu :) Hver enkelt af disse bidder kaldes okazaki-fragmenter.

Her spiller et andet enzym en vigtig rolle, DNA ligase, idet det sørger for at lave bindingen mellem fosfat- og sukkerenhederne i DNA'ets backbone.

Det var lige en (vigtig) detalje, jeg ikke fik med :)

Hej Mads

Tusind tak :0)

Kan jeg stille dig et spørgsmål en anden gang?

Ville jeg blive glad:0)

Tusind tak:0)

Du er velkommen, så må du jo se om jeg kan svare :)

Helt fantastisk forklaring - super brugbar..!!

TAK