Biokemi opgaver

1. 

a) Tegn strukturen for en peptid med sekvensen FTV.

b) Et eksperiment skal udføres hvor bindingen af peptider til et negativt ladet cellemembran skal studeres. To peptider skal testes:  

Peptid A med sekvensen: EGLVCNDTYAA

Peptid B med sekvensen: KHSQHNVHTH

i) Hvilke af de to peptider bindes bedst til membranet? Motiver kort dit svar

ii) Bindengen testes ved to pH: 6 og 9. Tror du bindingen øger, mindsker eller er uforandret ved forandring af pH fra 6 til 9 for peptiden du tror binder sig bedst i i)? Du kan antage at membranets egenskaber ikke forandres med pH. Motiver kort dit svar. 

2. 

a) Du har en blanding af to proteiner med følgende egenskaber: 

Protein 1: Masse 13.900 g/mol, pI 5.2 

Protein 2: Masse 45.000 g/mol, pI 6.5 

Beskriv en metode til hvordan protein 1 kan sepereres fra protein 2. Proteinet bør være funktionelt efter rensningen (ikke denautireret) og større mængder bør kunne isoleres (dvs. metoden skal være preparativ, ikke bare analytisk). Forklar også korfattet hvordan din valgte metode fungerer. 

b) Hvad anvender man røntgenkrysstlografi til i forhold tll studiet af proteiner? 

c) hvad anvendes MALDI-TOF til? 

Nogle der kan hjælpe med disse spørgsmål???