Intern standard????

Det er et relativt tung emne. Man kan tilsætte en intern standard af flere årsager. 

1) For at være sikker på at man har en robust metode; Hvis du har en kompleks peptidprøve fra fx. 100 forskellige proteiner så gør man nogen gange det at man tilsætter en intern peptid standard med samme koncentration i alle prøver. Dette betyder at man gennem 3-4-5 gentagelser af sit forsøg kan holde øje med disse kendte peptider for at se om de er ca. ens i alle prøver. Derved kan man sige at eventuelle afvigelser imellem prøverne ikke er afhængige af instrumentet og / eller prøve forberedelse.

2) For at lave en "labelfree quantification" hvis du fx. ved at du har tilsat 100 nmol af peptid 1,2,3,4 og 5. så kan du sammenholde størrelsen af peaks for disse ioner med de ioner der er i din prøve. Hvis du fx finder en peak der er 3 gange større kan du gå ud fra at der er ~300 nmol af det peptid i dine prøver.

Håber det er til at forstå.

Hov, jeg glemte helt den mest åbenlyse grund:

3) At kalibrere maskinen. Hvis du har en intern standard du ved har peaks ved 10,50,100,500 M/Z så kan du kalibrere efter de peaks og du ved at maskinen viser den korrekte masse der. (hvis fx. du får din 500 peak ved 501, kan du rykke alle peaks i det område 1 m/z tilbage)