Proteinsyntese (1. del)

RNA-syntesen styres rigtig nok af et enzym, der kaldes  RNA-polymerase. Det er et sammensat protein, der består af flere underenheder. En af dem kan binde polymerasen til bestemte DNA-områder, som ligger lige i starten af det enkelte gen (disse områder kaldes rigtig nok promotorområder).

Når RNA-polymerasen finder den specielle DNA-sekvens, der er karakteristisk for promotorer, bindes den til promotoren, og transkriptionen kan begynde.

Efter at polymerasen er bundet til DNA, adskilles de to strenge i DNA-molekylet, ved at hydrogenbindingerne brydes. Derefter er der plads til at starte selve RNA-syntesen. 

Bemærk at en DNA-sekvens aldrig kan have et startcodon AUG, men at det er det komplementære codon til startcodonet, som er siddende på DNA-strengen. Startcodonet AUG er altid lokaliseret på den komplementære RNA-sekvens. 

Men er det ikke helikase der åbner og DNA'et (adskiller strengene ved at bryde hydrogenbindingerne)? 

Jeg vil lige se om jeg har forstået det rigtigt:

1. DNA åbnes af enzymet helikass - Fungerer lidt ligesom en lynlås

2. RNA-polymerase sætter sig på en DNA-streng (DNA-sekvens). 

3. Frie nucleotider sætter sig på og en ny streng dannes (er dette RNA-strengen?) 

Jeg forstår bare ikke hvordan DNA bliver til RNA. Kan I give mig en forklaring på dette? 

DNA transkripteres til RNA ved hjælp af enzymet RNA-polymerase. RNA-polymerase, der består af mange underenheder som #1 også nævner, binder sig til DNA-sekvensen, der skal transkripteres, og påbegynder en syntese af mRNA. Selve syntesen foregår på den måde, at hver gang RNA-polymerase har analyseret et basepar på DNA-strengen sættes det korrekte nukleotid på mRNA ud fra baseparringsreglerne. På den måde vil der blive produceret et mRNA, der koder for specifikke aminosyrer, og mRNA kan nu translateres i ribosomerne. 

Jeg forstår det virkelig ikke.. 

Hvad er det, du ikke forstår? :)

Hvordan RNA og dets baser kommer ind i billedet. 

Vil det sige at DNA deles i to enkeltstrenge, og så kommer RNA og og baseparrer med DNA-skabelonstreng, og følder denne regel A - U, C - G?

Hvis dette er tilfældet, hvordan kan man så omformulere det så det kommet til at lyde mere korrekt?  

Ja, helikase deler DNA-strengen, så transkription kan foregå. Du kan ikke sige, at RNA kommer og baseparrer med DNA. RNA-polymerasen katalyserer RNA-syntesen. Der er jo mange nukleotider i cellekernen, som bliver brugt i mRNA-syntesen. RNA-polymerasen genkender blot DNA-sekvenser og kan ud fra en DNA-sekvens lave en tilsvarende mRNA streng, som koder for præcis de samme aminosyrer, som der forefindes i arvematerialet. 

RNA er ligesom DNA opbygget af nukleotider, men RNA's opbygning adskiller sig fra DNA's på tre punkter (som jeg ikke kommer ind på her). 

RNA-molekyler dannes ved transkription. Dette sker med udgangspunkt i DNA, således at baserækkefølgen i et gen - et DNA-stykke - ved baseparringsprincippet danner udgangspunkt for baserækkefølgen i det nydannede RNA. 

De tre vigtigste former for RNA er:

rRNA - ribosomalt RNA, som er med til at opbygge ribosomerne

mRNA - messenger-RNA, som transporterer information om proteiners aminosyresammensætning fra DNA i kernen til ribosomerne i cytoplasmaet.

tRNA  - transport-RNA, som transporterer aminosyrer til robosomet, hvor de bruges i proteinsyntesen.

DNA'et deles ikke i to enkeltstrenge, men RNA-polymerasen "løber" ned af DNA-strengen. Efter at RNA-polymerasen har passeret et område på DNA-dobbeltstrengen, og RNA'et er dannet, lukkes DNA-dobbeltstrengen igen ved at hydrogenbindingerne genetableres.

#10 

Faktisk på flere områder. Hvis trådstarter er interesseret kan forskellene mellem DNA og RNA ses her: 

http://chemistry.about.com/od/lecturenoteslab1/a/Dna-Versus-Rna.htm

#11

Forstår ikke lige helt hvad du mener :-)

Altså, at RNA-polymerasen passerer flere områder? Hvis ja, så er det korrekt. 

#13

Ah okay, jamen så kan du måske opdatere mig lidt. :-)

RNA's opbygning vs. DNA's opbygning:

- RNA indeholder pentosen ribose i stedet for deoxyribose.

- I stedet for den nitrogenholdige pyrimidinbase thymin indholder RNA uracil. Uracil og thymin er opbygget næsten ens, men thymin indeholder en methylgruppe ved atom nr. 5 i pyrimidringen.

- RNA er normalt enkeltstrenget, mens DNA er dobbeltstrenget. I nogle RNA-molekyler snor enkeltstrengen sig dog således, at der er områder, hvor der sker en baseparring med andre områder på det samme RNA-molekyle. 

#13-14

Ah okay. Jeg snakker opbygning, du tænker funktion/egenskab etc.

#13-14

"...men RNA's opbygning adskiller sig fra DNA's på tre punkter (som jeg ikke kommer ind på her)."

:-)

#18

Så stadig tre forskellige ang. opbygningen?