PH´s betydning for enzymer

citat:

skyldes at pH påvirker enzymets proteindel. Ladningen blandt aminosyrernes syrebase grupper ændres og derved forstyrres de ionbindinger der er med til at opretholde enzymets rumlige struktur. Derved ændres enzymets aktive center på en sådan måde at det ikke kan binde substratmolekyler optimalt mere.

Resultatet er at jo længere væk fra enzymets optimale pH man kommer jo færre enzymmolekyler vil virke optimalt. 

taget fra : http://www.bioweb.dk/bioemner/enzymer/enzym_faktorer.html

håber du kan bruge det

 Kender du bogen 'Biokemi og molekylærbiologi' - den er bare suveræn. Den har et helt kapitel kun med enzymer (på højt niveau - bruges på uni og bio A som jeg selv har afsluttet i år)

Den nemmeste måde at forklare det på er ved at komme med et eksempel. Inden jeg kommer med det vil jeg dog lige snakke lidt generelt. Enzymer kan blive inaktivt af flere årsager bl.a. hvis man ændrer dens struktur, eller hvis man ændrer bare en lille smule i det aktive site. Normalt vil en lille pH ændring ikke gøre nogle skader rent strukturelt men i særlige tilfælde kan en lille pH ændring have stor betydning for det aktive site.

Hvis vi ser på det aktive site af glyceraldehyd 3-phosphate dehydrogenase:  (http://www.google.dk/imgres?imgurl=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK22593/bin/ch16f8.jpg&imgrefurl=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK22593/&usg=__SC-xmmhlFf_ZTJpChuVzIYmbbcY=&h=638&w=710&sz=127&hl=da&start=0&zoom=1&tbnid=FYn7uIpvG2x-MM:&tbnh=148&tbnw=165&ei=CVH7Tc3VN4SBOoTHjL4E&prev=/search%3Fq%3Dcatalytic%2Bmechanism%2Bof%2Bglyceraldehyd%2B3-phosphate%2Bdehydrogenase%26um%3D1%26hl%3Dda%26safe%3Doff%26client%3Dfirefox-a%26sa%3DN%26rls%3Dorg.mozilla:en-US:official%26biw%3D1280%26bih%3D920%26tbm%3Disch&um=1&itbs=1&iact=rc&dur=237&page=1&ndsp=30&ved=1t:429,r:0,s:0&tx=76&ty=52&biw=1280&bih=920)

(Ked af det lange link men kunne ikke sige hvis i fuld så du bliver nødt til at downloade det)

Som det ses er den meget afhængig af en histidine's ladning (En aminosyre som er en femkant med 2 N'er).

Histidine har en pKa på 6 (halvdelen af stoffet er protoneret ved pH 6) altså når vi nærmer os pH 6 (fra over pH 6) vil det aktive site have sværere ved at fungere da den aktuelle histidine måske allerede er ladet og derved ikke kan fulføre sin mekanisme.

Cellen har dog nogle måder at undgå dette på men det vil jeg ikke komme ind på.

Det var basis håber det kan bruges