Kemi
Ionkanalernes undersøgelse....
http://peecee.dk/?id=38227
Det omhandler om undersøgelse af ionkanaler vha. en teknik som kaldes patch-camp. Genteknologiske undersøgelser af spændingsafhængige Na+ kanaler har vist, at kanalen kodes af ét gen og udgøres af fire næsten ens proteinsekvenser. Hver sekvens indeholder seks alfa-helix-områder og en peptidsløjfe, som trænger ned i kanalen. Man antager at det lilla segment - som rigt på positive aminosyrer - forskubbes, når potentialet ændres. Dette ændrer P-segmentets position/struktur i kanalen og åbner derved for Na+ ionen. Hvis man fraspalter det lille peptidsegment, som forbinder III og IV, forhindrer man stort ser inaktiveringen.
Det var lidt baggrundsviden omkring undersøgelse af ionkanaler. Jeg ønsker at nogen vil redegør for hver trin hvad der sker. Og hvad COOH og NH2 betydning er i figur 1?
Hvad skal 1,2,3,4,5,6 betyde i figur 2.
Og hvad viser figur 3.
På forhånd tak!
Svar #1
07. maj 2006 af Dr. MolBio (Slettet)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Search&db=books&doptcmdl=GenBookHL&term=the+sodium+channel+AND+stryer%5Bbook%5D+AND+215975%5Buid%5D&rid=stryer.section.1801#1818
Bemærk yderligere figur 13.20, som kan hjælpe dig med at forstå dine egne figurer.
Jeg vil ikke redegør for de forskellige trin for dig, men jeg vil gerne hjælpe.
1,2,3,5,6.. er de forskellige fem hydrofobe segmenter i kanalen.
Svar #2
07. maj 2006 af Jelly (Slettet)
Kan du evt. forklare mig hvad man ser i figur 1 i http://peecee.dk/?id=38227.
Det vil hjælpe for så jeg selv kan tænker videre med figur 2.
Svar #3
07. maj 2006 af Jelly (Slettet)
Det kunne være rart med en forklaring på figur 1.
På forhånd tak.
Svar #4
07. maj 2006 af Dr. MolBio (Slettet)
COOH og NH3 Viser blot proteinets strat og slut sted.
Figur 1 viser den overordnede kvartenære struktur af proteinet som transporterer Na+ ioner over membranen. På figuren ses, at peptidet består af fire (I, II, III og IV) segemnter (domæner), som alle ligner hinanden.
Inaktivering betyder højest sansynligt, at hvis peptidet bliver klippet der, vil det blive inaktivt.
Held og lykke...
Svar #5
07. maj 2006 af Jelly (Slettet)
Dvs. i figur 2 ser vi blot den indvendige side af peptidets segment. Hvilket består af hydrobe segmenter i kanalen. Men hvad består et P-segment af?
Figur 3 viser vel bare at segmenter findes overalt i celler?
På forhånd tak!
Svar #6
07. maj 2006 af Jelly (Slettet)
Svar #7
07. maj 2006 af Dr. MolBio (Slettet)
#5: Ja figur 2 viser domæne II som består af de fem alpha-helixer samt p-segmentet. Dvs. den viser den tertiære struktur.
Fig. 3 viser, hvordan proteinet er placeret i plasmamembranen, dvs. at den er gennemgående, hvilket man kunne have sagt sig selv, de den transporterer ioner.
Så vidt jeg kan se, så består p-segmentet også af alpha-helixer, ned igennem membranen. Det er meget svært at se på den figur, der skulle i dette tilfælde laves et hydropati-index, før man kunne bestemme hvad det er.
Men såvidt jeg ved, er det kun poriner som består af gennemgående beta-sheets gennem plasmamembranen.
Skriv et svar til: Ionkanalernes undersøgelse....
Du skal være logget ind, for at skrive et svar til dette spørgsmål. Klik her for at logge ind.
Har du ikke en bruger på Studieportalen.dk?
Klik her for at oprette en bruger.