Kemi

DNA - syre, Na+, vand...

17. december 2006 af LeMenga (Slettet)

Hej på forummet. Jeg sidder og læser en masse om DNA og er løbet ind i et par spørgsmål:

1) I DNA står A'et for acid : syre, men kigger man på en DNA-kæde, er der inden H-atomer på phosphat-gruppen? Hvorfor kaldes DNA så en syre?

2) Hvilken rolle spille Na+ ioner og vand hos DNA. Har læst mig lidt frem til, at hvis der ikke var nogen Na+ ioner til at "dæmpe" phosphat-gruppernes negative poler, så ville DNA'et ikke kunne hænge sammen. Og i forbindelse med dette spiller vand også en rolle, da vandet hydrogenbinder sig til nogle N- og O-atomer - hvad betyder dette? Stabilitet?

3) Jeg har ekstraheret DNA ud fra et løg, og tilsætter løgstykkerne Na+ ioner samt vaskemiddel, varme på det og tilsætter nogle enzymer der nedbryder proteinerne i cellerne. Det hele filteres, filtratet tilsættes nu noget iskoldt ethanol - det skal ligge som en fase oven på løg-ekstraktet. Nu trækker DNA'et op i denne fase.

Mit spørgsmål til 3) er så, hvad Na+ ionerne egentlig gør ved DNA'et. Mit gæt, ved at øge koncentrationen, holder Na+ bedre sammen på DNA'et. Og samtidig sørger det for at DNA'et bliver upolært, og derfor kan det trække op i ehtanolen. Er dette rigtigt?

Tusind tak, Anders

Brugbart svar (0)

Svar #1
18. december 2006 af Larsendrengen (Slettet)

Acid kommer af at DNA også indeholder en phosphatgruppe som binder de enkelte sukker-base enheder sammen. Så DNA kan betragtes som værende opbygget af phosphorsyre-sukker-base kaldet et nucleotid.

Ved fysiologisk pH er phosphatgruppen negativt ladet, og skal derfor ahve en mod-ion, og det er så Na+

Svar #2
18. december 2006 af LeMenga (Slettet)

Okay tak, men hvordan kan det så være at indikatorpapir bliver rødt når man lægger noget DNA på det? Reagere papiret ikke kun på H3O-ioner og OH-ioner?

Og passer min teori om, at de ekstra Na+-ioner gør DNA'et upolært og derfor opløseligt i ethanol?

Brugbart svar (0)

Svar #3
18. december 2006 af Larsendrengen (Slettet)

pH af væsken skal jeg ikke kunne udtale mig om da jeg ikke ved præcist hvad der er sket, samt hvad løg-saft/vaskemiddel etc gør ved pH.

Upolært er så meget sagt, men man får elektroneutralitet, og derved nemmere ved at ekstrahere det over i ethanolfasen.

Ja det er rigtigt som du skriver at back-bone'et i DNA, som udgøres af sukker-phosphat, vil kunne frastøde hinanden pga negativ-negativ ladning vekselvirkninger, og at det "ophæves"/mindskes ved at have kationer tilstede (Na+).

Svar #4
18. december 2006 af LeMenga (Slettet)

I den forsøgsvejledning jeg fik udleveret til ekstrahtionen, står der tilsidst når man har DNA'et liggende i ethanol, at man kan dyppe noget indikatorpapir ned og konstatere at DNA er en syre. Har så undrede mig meget over dette, for kan ikke rigtig finde ud af hvilken del af phosphor-gruppen det skulle være?

Men tusind tak for det andet svar.

Brugbart svar (0)

Svar #5
18. december 2006 af Larsendrengen (Slettet)

http://dl.clackamas.edu/ch106-09/nucleoti.htm

http://en.wikipedia.org/wiki/DNA

osv osv

Der er masser af links.

Men det er den frie OH på Phosphor som indeholder det sure H.

Svar #6
18. december 2006 af LeMenga (Slettet)

Arh så er jeg med, mange tak for det !

Skriv et svar til: DNA - syre, Na+, vand...

Du skal være logget ind, for at skrive et svar til dette spørgsmål. Klik her for at logge ind.
Har du ikke en bruger på Studieportalen.dk? Klik her for at oprette en bruger.